Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf239P24399 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf239P24399 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf239P24399 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf239P24399 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms