Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gria1P23818 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms