Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd8P23463 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms