Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PparaP23204 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PparaP23204 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PparaP23204 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PparaP23204 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PparaP23204 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PparaP23204 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PparaP23204 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PparaP23204 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PparaP23204 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PparaP23204 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PparaP23204 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PparaP23204 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PparaP23204 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PparaP23204 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PparaP23204 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PparaP23204 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PparaP23204 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PparaP23204 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PparaP23204 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PparaP23204 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PparaP23204 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PparaP23204 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PparaP23204 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PparaP23204 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms