Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx3P23198 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms