Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tap1P21958 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms