Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms