Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb9P20615 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb9P20615 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms