Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP20293 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TP20293 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TP20293 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TP20293 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TP20293 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TP20293 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TP20293 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms