Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou5f1P20263 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms