Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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