Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ifrd1P19182 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms