Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc1P19123 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms