Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18525 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18525 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18525 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18525 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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