Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18524 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18524 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18524 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18524 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18524 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18524 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18524 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18524 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18524 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18524 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18524 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18524 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18524 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18524 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18524 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18524 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18524 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P18524 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
P18524 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18524 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18524 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18524 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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