Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms