Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spi1P17433 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Spi1P17433 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spi1P17433 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spi1P17433 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spi1P17433 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Spi1P17433 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Spi1P17433 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Spi1P17433 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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