Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms