Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkceP16054 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkceP16054 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkceP16054 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms