Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf6P15375 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Myf6P15375 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myf6P15375 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms