Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dnmt1P13864 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnmt1P13864 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms