Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn1P12960 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn1P12960 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms