Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt8P11679 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt8P11679 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt8P11679 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms