Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms