Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Schip1P0DPB4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms