Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxc9P09633 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms