Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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