Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefmP08553 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefmP08553 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefmP08553 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefmP08553 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefmP08553 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefmP08553 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefmP08553 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefmP08553 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefmP08553 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefmP08553 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefmP08553 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NefmP08553 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefmP08553 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NefmP08553 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefmP08553 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefmP08553 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefmP08553 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefmP08553 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefmP08553 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NefmP08553 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NefmP08553 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NefmP08553 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NefmP08553 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NefmP08553 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NefmP08553 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NefmP08553 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NefmP08553 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NefmP08553 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NefmP08553 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NefmP08553 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms