Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Egr1P08046 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms