Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms