Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SparcP07214 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SparcP07214 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SparcP07214 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SparcP07214 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SparcP07214 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SparcP07214 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SparcP07214 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SparcP07214 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms