Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf1P07141 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms