Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrygdP04342 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms