Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms