Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt1P04104 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt1P04104 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt1P04104 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms