Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lamc1P02468 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms