Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3f3cP02301 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms