Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01789 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01789 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01789 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01789 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01789 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01789 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01789 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01789 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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