Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01680 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01680 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01680 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01680 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01680 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01680 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01680 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01680 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01680 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01680 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01680 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01680 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms