Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01646 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01646 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01646 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01646 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01646 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01646 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01646 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01646 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01646 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01646 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01646 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01646 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01646 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01646 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01646 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01646 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms