Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01645 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01645 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01645 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01645 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01645 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01645 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01645 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01645 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01645 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01645 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01645 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01645 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01645 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01645 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01645 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01645 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms