Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifnb1P01575 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms