Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sp1O89090 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp1O89090 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sp1O89090 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp1O89090 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms