Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CcnkO88874 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CcnkO88874 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CcnkO88874 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CcnkO88874 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CcnkO88874 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CcnkO88874 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CcnkO88874 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms