Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BlmO88700 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BlmO88700 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BlmO88700 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BlmO88700 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BlmO88700 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BlmO88700 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BlmO88700 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BlmO88700 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BlmO88700 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BlmO88700 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BlmO88700 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BlmO88700 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BlmO88700 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BlmO88700 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BlmO88700 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BlmO88700 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BlmO88700 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BlmO88700 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BlmO88700 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BlmO88700 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BlmO88700 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BlmO88700 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BlmO88700 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BlmO88700 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BlmO88700 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BlmO88700 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BlmO88700 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BlmO88700 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BlmO88700 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BlmO88700 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BlmO88700 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BlmO88700 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BlmO88700 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BlmO88700 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BlmO88700 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BlmO88700 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BlmO88700 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BlmO88700 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BlmO88700 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BlmO88700 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BlmO88700 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BlmO88700 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BlmO88700 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BlmO88700 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BlmO88700 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BlmO88700 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BlmO88700 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BlmO88700 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BlmO88700 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BlmO88700 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BlmO88700 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BlmO88700 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BlmO88700 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BlmO88700 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BlmO88700 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BlmO88700 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BlmO88700 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BlmO88700 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BlmO88700 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BlmO88700 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BlmO88700 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms