Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sap30O88574 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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