Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops3O88543 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops3O88543 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms