Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3aO88508 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnmt3aO88508 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms