Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms