Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp26a1O55127 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26a1O55127 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms